研究方向：
1. 逆境訊息傳導：以系統生物學分析植物在環境逆境下之調控機制：

植物為固著生物，當處於逆境下如寒害、熱逆境、乾旱、重金屬汙染及其他生物性逆境，如蟲害、病原菌感染的狀況下無法透過移動來躲避逆境。如其他生物，植物對環境逆境做出反應前必須先感知、辨識到逆境再做出反應，儘管已有許多研究探討各種逆境下，植物面對逆境可能的反應與調節之傳遞路徑，然而完整描述與提出詳細之分子機制仍有待探討。我的研究室藉由轉錄圖譜分析處於逆境下植物基因轉錄層級之變化。透過分析我們發現許多環境逆境皆會誘導氧化壓力、鈣離子、CDPK、MAPK等參與植物的逆境傳導訊息途徑中，但對於植物面對各類環境刺激如何透過共同會誘導的訊息傳遞路徑調控不同反應及各逆境誘導的專一訊息調控途徑仍有待釐清。藉由對植物逆境下轉錄體變化與的了解，期望未來能對植物育種與可能發生的糧食問題有一份貢獻。



2. 微生物協助極端環境逆境下植物之生理與生長運作

二十一世紀裡，由於氣候變遷、人為造成的環境污染等問題，生物族群如何面對極端環境之影響已成為生態學及演化學領域中重要的議題。雖已有許多研究探討生物體處於極端環境下之分子層面機制，自然環境中植物如何適應極端環境棲地之機制仍屬未知。近期許多研究發現植物與根際微生物建立之關係有助於植物適應極端環境，其中微生物揮發物能幫助植物在適應逆境為近年發展之議題。在我的近期研究與計畫中，將採集生長於野外之物種，分析比較生長於耐極端環境與正常植物間之生理、轉錄圖譜及其根際宏觀轉錄體學，藉以了解極端環境下植物之基因體演化與耐受極端環境之分子機制。藉由次世代定序分析植物根部轉體與宏觀轉錄體，我們將更了解植物與極端環境互動之生物機制，此項研究之貢獻將在於為後續植物對極端環境之反應與適應機制提供更全面的了解，提供後續對野生物種之分子機制與演化適應層面分析之基石。另一部分也透過基因體學工具針對微生物揮發物影響植物在逆境下之生理與訊息調控路徑進行更深入之探討。

2013 榮膺中國生物學會理事長並獲得 該學會 生物科學研究傑出獎
2009 – present 國立成功大學 特聘教授